结核性脑膜炎治疗的原则是早期给药、合理选药、联合用药及系统治疗，只要患者临床症状、体征及实验室检查高度提示本病，即使抗酸染色阴性也应立即开始抗结核治疗。
1、抗结核治疗
异烟肼、利福平、吡嗪酰胺或乙胺丁醇链霉素，是治疗结核性脑膜炎最有效的联合用药方案。儿童因乙胺丁醇的视神经毒性作用、孕妇因链霉素对听神经的影响而尽量不选用。
（1）异烟肼。异烟肼可抑制结核杆菌DNA合成，破坏菌体内酶活性，对细胞内、外结核杆菌均有杀灭作用。无论脑膜有无炎症，均能迅速渗透到脑脊液中。单独应用易产生耐药性。主要不良反应有末梢神经炎、肝损害等。
（2）利福平。利福平与细菌的RNA聚合酶结合，干扰mRNA的合成，抑制细菌的生长繁殖，导致细菌死亡。对细胞内外结核杆菌均有杀灭作用。利福平不能透过正常的脑膜，只部分通过炎性脑膜，是治疗结脑的常用药物。单独应用也易产生耐药性。主要不良反应有肝毒性、过敏反应等。
（3）吡嗪酰胺。在酸性环境中杀菌作用较强，pH5.5时杀菌作用最强，能杀灭酸性环境中缓慢生长的吞噬细胞内的结核杆菌，对中性和碱性环境中的结核杆菌几乎无作用。吡嗪酰胺能够自由通过正常和炎性脑膜，是治疗结核性脑膜炎的重要抗结核药物。主要不良反应有肝损害，关节酸痛、肿胀、强直、活动受限，尿酸增加等。
（4）链霉素。这是氨基糖苷类抗生素，仅对吞噬细胞外的结核菌有杀灭作用，为半效杀菌药。链霉素能透过部分炎性的脑屏障，是结核性脑膜炎早期治疗的重要药物之一。主要不良反应有耳毒性和肾毒性。
（5）乙胺丁醇。乙胺丁醇与二价锌离子络合，干扰多胺和金属离子的功能，影响戊糖代谢和脱氧核糖核酸、核苷酸的合成，抑制结核杆菌的生长。对生长繁殖状态的结核杆菌有作用，对静止状态的细菌几乎无影响。主要不良反应有视神经损害、末梢神经炎、过敏反应等。
2、皮质类固醇
皮质类固醇，这种药物用于脑水肿引起颅内压增高，伴局灶性神经体征和蛛网膜下腔阻塞的重症患者，可减轻中毒症状，抑制炎症反应及减轻脑水肿。
3、药物鞘内注射
脑脊液蛋白定量明显增高、有早期椎管梗阻、肝功能异常致使部分抗结核药物停用，以及在慢性、复发或耐药的情况下，在全身药物治疗的同时可辅以鞘内注射，直至CSF检查正常。不过，如果是脑脊液压力较高的患者，务必要慎用此法。
4、降颅压
颅内压增高者可选用渗透性利尿剂，如20%甘露醇、甘油果糖或甘油盐水等，同时需及时补充丢失的液体和电解质。
结核性脑膜炎是可治之症，并没有那么可怕。抗结核药异烟肼、吡嗪酰胺等都能很好地“透过血脑屏障”，再联合使用链霉素、乙胺丁醇等，一般都能取得满意的效果，但用量要比治疗肺结核大、疗程也长，大约需两年的时间， 过早停药易复发。患者一定要在医生的指导下，密切配合坚持用药以完成治疗。