1.实验室检查
1）血象：呕吐引起吸入性肺炎并迁延不愈时，可出现感染性血象，如原发病因为感染引起的呕吐，如败血症，呼吸道感染，泌尿系统感染等，也为感染性血象。
2）血气分析及血生化检查：可了解患儿是否存在酸中毒，电解质紊乱，血钠，钾，氯以及肝功能等，可结合具体病情选送。
3）尿、便常规：应做尿，便常规和大便潜血实验等。
4）脑脊液检查：中枢神经系统感染或颅内出血等，脑脊液检查有相应改变。
5）内分泌及遗传代谢病检查：如已排除消化道，中枢神经等疾病，而患儿仍然频繁呕吐，应进一步做内分泌，代谢病方面检查，一些先天性代谢性疾病由于代谢紊乱而导致呕吐，如氨基酸代谢疾病(高氨血症，苯丙酮尿症，甘氨酸血症)，糖代谢疾病(半乳糖血症，枫糖尿症)，肾上腺皮质增生症等，应作血氨，血糖等相应实验室检查。
2.辅助检查
1）X线检查：
①腹部透视和摄片：腹部透视和摄片是新生儿呕吐时最常用的诊断方法，为了更好地观察胀气的肠曲和液平，应该采用立位透视和摄片，也可以采用侧位水平投照法摄片。
②钡餐或钡灌肠检查：可以观察食管，胃和肠道的形态和功能，对消化道疾道德败坏的诊断有重要价值，疑有胃肠道完全性梗阻或穿孔的新生儿，禁用钡剂造影，疑有食管闭锁或食管气管瘘者可用水溶性碘剂造影，并于造影后及时将造影剂吸出。
③超声检查：超声检查对腹水的探查，腹部肿物部位和性质的诊断，腹腔内游离气体的存在等，都具有很高的敏感性和特异性，对胆总管囊肿，肾上腺皮质增生症，新生儿坏死性小肠结肠炎等疾病的诊断方面都优于X线检查，现在，肥大性幽门狭窄的超声检查已经基本取代了钡餐检查，超声检查不仅可以观察到胃肠道的某些改变，而且能直接观察肝胆系统，泌尿系统，循环系统等改变及其对消化道的影响，对呕吐病因的诊断有很大帮助。
④胃镜：新生儿常需在全身麻醉下进行，临床应用较少，胃镜检查可以对粘膜充血，出血，水肿，溃疡，瘢痕，肿瘤和先天畸形等情况进行直接的观察，对某些食管，胃部疾病具有确诊意义。
2）B超：因病因不同而异，对幽门肥厚性狭窄，可做腹部超声检查，颅内出血或其他占位病变，应做头颅B超。
3）脑CT：有颅内压增高表现时应作脑CT检查，以明确脑水肿，脑积水，颅内出血，颅内肿瘤等中枢神经系统病变引起的呕吐。
4）鼻胃管检查：是一种简单有效的检查上消化道畸形的方法，当遇到母亲羊水过多，或出生后短期内婴儿出现口吐螃蟹样泡沫时，应该在产房内下鼻胃管检查，正常时鼻胃管能够顺利进入胃内，并抽出少量液体，如鼻胃管下降受阻或从口腔或鼻腔内折返回来，提示食管闭锁。